厚生労働省では特定健診と診療報酬明細書のデータを比較分析するため、4年前に約5億円をかけてデータベースを構築している。しかし、明細書約58億件のうち約80%が突き合わせできないことがわかった（NHKニュース）。

このデータベースは、メタボと診断された人がその後どのような病気にかかり、どれだけの医療費を使ったかを調べるために4年前に作られたという。しかし、去年このデータを実際に分析しようとしたところ、明細書データのおよそ80%が突き合わせできなかったという。データベースには特定健診のデータと診療報酬明細書のデータが含まれており、それぞれのデータは名前や生年月日が暗号化されて登録されている。ところが健診のデータは名前がカタカナで入力されていたいっぽう、明細書では漢字で入力されているなど、それぞれの明細書の書式は異なっており、そのため暗号化（ハッシュ化？）されたデータでの照合ができなかったようだ。

特定健診はデジタル化されているものの、明細書は未だ手書きが残っており、書式も統一化されていないことが背景にあるようだ。しかしなぜ設計時に気づかなかったのか、なぜ去年まで発覚しなかったのか、なぜ原因調査にこれほど時間がかかっているのかなど疑問点は多い。共通番号制度が医療にも導入されればこういった問題は起きないのかもしれない。